Centrado en el árido Cuerno, al este de las Tierras Altas de Etiopía, el Hotspot de Biodiversidad del Cuerno de África también cubre el Valle del Rift, que divide las Tierras Altas de Etiopía en dos bloques principales, los matorrales xéricos del noreste de Kenia y las partes costeras del sur de la Península Arábiga. Políticamente, esto incluye la mayor parte de Somalia, todo Yibuti, partes de Etiopía, Eritrea, Kenia, Yemen y Omán, y una pequeña parte del lejano noreste de Sudán. También se incluyen en el punto crítico el archipiélago de Socotra frente a la costa del noreste de Somalia y unos cientos de pequeñas islas en el Mar Rojo.

Uno de los dos únicos puntos críticos que es completamente árido, la región alberga una serie de antílopes endémicos y amenazados: el dibatag vulnerable (ammodorcas clarkei) y Gacela de Speke en peligro de extinción (Gazella habla) entre ellos.

Otras endémicas distintivas que se encuentran aquí incluyen el asno salvaje somalí en peligro crítico (Equus africanos somaliensis) y el babuino hamadryas (papio hamadryas). El Cuerno de África también alberga más reptiles endémicos que cualquier otra región del continente.