Hoy, de los 5,050 kilómetros cuadrados de hábitat relativamente prístino que quedan en el Hotspot de Biodiversidad de Nueva Caledonia, 4,000 son selvas tropicales y 1,000 son maquis de altitud baja a media. El bosque esclerófilo alguna vez cubrió aproximadamente el 23 por ciento de Nueva Caledonia, pero ahora solo existe en un parche de unos 45 kilómetros cuadrados. Esta área en sí misma generalmente está muy degradada y fragmentada en parches más pequeños de 20 a 30 hectáreas o menos, que están rodeados de tierras agrícolas. Las amenazas actuales a la biodiversidad del hotspot incluyen:
Minería de níquel
Nueva Caledonia tiene los depósitos de níquel más grandes del mundo. La minería del níquel genera alrededor del 90 por ciento de las divisas de la región y produce la mitad del níquel del mundo. Sin embargo, este activo también es una amenaza para los ecosistemas del hotspot. Los impactos de la industria minera del níquel han sido devastadores. La minería a cielo abierto ha provocado grandes extensiones de deforestación y destrucción de hábitats, lo que ha dado lugar a laderas desnudas y montones de desechos. La erosión de las áreas devastadas por la minería ha causado la sedimentación y destrucción de arroyos y áreas de arrecifes de coral en alta mar y la contaminación de los suministros de agua.
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Las especies madereras más valiosas ya se han ido del hotpsot, pero incluso la tala limitada amenaza los hábitats de las especies con áreas de distribución muy restringidas.
Caza
Al igual que otras islas del Pacífico, la caza y la modificación del hábitat desde la llegada de los primeros humanos ha provocado una serie de extinciones, incluidas 11 especies de aves no paseriformes, y sigue representando una amenaza para la paloma imperial de Nueva Caledonia (Ducula goliat) y a los zorros voladores. La demanda internacional de especies raras de aves y animales marinos, como el periquito cornudo vulnerable (Eunymphicus cornutus) y un cefalópodo "fósil viviente" endémico (Nautilus macromphalus), amenaza las ya escasas poblaciones de estas especies.
Especies foráneas
La introducción intencional y accidental de especies exóticas en el hotspot con fines alimentarios o recreativos ha sido devastadora. Hay casi 800 especies de plantas exóticas, más de 400 invertebrados exóticos y unos 35 vertebrados exóticos establecidos en las islas (incluido un anfibio introducido), superando y reemplazando gran parte de la vegetación original y las especies de fauna. Entre las más problemáticas de estas introducciones ha sido probablemente la rata negra (Rattus rattus), el ciervo de Java (Rusa timorensis) y la hormiga de fuego (Wasmannia auropunctata). Los cerdos, gatos, ciervos y ratas se encuentran desde el nivel del mar hasta las elevaciones más altas y están presentes en toda la isla principal. El efecto combinado de estas cuatro especies está destruyendo rápidamente especies y ecosistemas.