La rica biodiversidad y el alto endemismo de Nueva Caledonia se deben a su larga evolución aislada, así como a la variedad de niveles de precipitación y suelos ultrabásicos muy particulares que cubren más de un tercio del país.
Plantas
El endemismo en el hotspot es especialmente alto entre las plantas vasculares. Hay alrededor de 3,270 especies de plantas registradas en las islas, alrededor del 74 por ciento de las cuales son endémicas. También hay 108 géneros endémicos y cinco familias de plantas endémicas notables: Amborellaceae, Paracryphiaceae, Strasburgeriaceae, Oncothecaceae y Phellinaceae. Entre los países, solo Australia, Sudáfrica y Madagascar tienen familias de plantas más endémicas; estas naciones también son mucho más grandes que Nueva Caledonia. Dado este notable endemismo florístico, Nueva Caledonia a menudo se considera un subreino florístico distinto.
exoticas
De más de 100 aves que se encuentran en Nueva Caledonia, más de 20 son endémicas. Hay tres géneros endémicos, dos de los cuales son monotípicos, incluido el kagu en peligro de extinción (Rhynochetos jubatus), el único miembro vivo de la familia endémica, Rhynochetidae. Otras especies de aves distintivas incluyen la paloma imperial endémica de Nueva Caledonia (Ducula goliat), que es la paloma arbórea más grande del mundo, la endémica paloma de plumas hendidas (Drpanoptila holosericea), y el chotacabras mochuelo de Nueva Caledonia, en peligro crítico (Aegotheles savesi), conocido a partir de unos pocos especímenes.
Los mamíferos
Las nueve especies de mamíferos terrestres de Nueva Caledonia son murciélagos, seis de los cuales son endémicos, incluido el murciélago orejudo de Nueva Caledonia, en peligro crítico de extinción (Nyctophilus nebulosus), que fue descubierto en 1991 alrededor de Numea. Los murciélagos han sido poco estudiados y el potencial para descubrir nuevas especies es alto.
reptiles
Hay un nivel extremadamente alto de endemismo de reptiles en este hotspot. Más de 60 de unos 70 reptiles terrestres son endémicos, al igual que 11 de 23 géneros. Casi todas estas especies son lagartijas en dos familias de gecos y una familia de eslizones. Los más conocidos entre estos son los geckos gigantes del género endémico Racodactylus. El gecko gigante de Nueva Caledonia (R. leachianus), el gecko más grande del mundo, puede crecer hasta 28 centímetros de largo y pesar hasta 700 gramos. La piel del párpado de Bocourt en peligro de extinción (Foboscincus bocourti), un lagarto de 50 centímetros de largo, se conocía previamente a partir de un solo espécimen capturado alrededor de 1870 y se supuso extinto durante mucho tiempo. En 2003, en un pequeño islote, se redescubrió la especie.
Anfibios
No hay anfibios nativos en Nueva Caledonia.
Peces de agua dulce
La diversidad acuática en las islas es alta dado el tamaño del hotspot, con unas 85 especies de peces de agua dulce, aunque menos de 10 son endémicas. La especie más notable es quizás el galáxiido endémico en peligro de extinción (Galaxias neocaledónicas), el representante más septentrional de un grupo que se restringe principalmente a los extremos meridionales de Nueva Zelanda, Australia, América del Sur y África. Un solo género, Protogobio, es endémica.
Invertebrados
Entre los invertebrados, el hotspot sustenta una rica diversidad endémica de caracoles terrestres. El mayor de estos, Placostylus fibratus, puede crecer hasta más de 15 centímetros de largo y pesar hasta 100 gramos.
El hotspot tiene unas 37 especies de macrocrustáceos, de las cuales el 40 por ciento son endémicas. La isla Grande Terre es una de las islas con mayor biodiversidad para este grupo taxonómico, con especies que se encuentran solo en sustratos ultrabásicos y otras solo en algunos ríos cortos y oxigenados del norte.
Hasta la fecha se han catalogado unas 4,000 especies de insectos, mostrando un alto endemismo a nivel de especie y género. Se proyecta que la fauna total de insectos en el hotspot sea de entre 8,000 y 20,000 70 especies, incluidas más de 300 especies nativas de mariposas, más de 16 especies de polillas y XNUMX escarabajos tigre.
Casi 200 arañas han sido reconocidas hasta ahora, incluyendo Bradystichidae, la única familia de arañas endémica de una sola isla.